Ainsi que l’a rappelé Étienne Ruppé (INSERM UMR 1137, hôpital Bichat - Paris), le microbiote intestinal est composé d’un très grand nombre de bactéries, la plupart étant des anaérobies strictes non ou très difficilement cultivables.
Ce vaste ensemble renferme essentiellement des espèces commensales mais aussi, en faible proportion, des bactéries pouvant causer des infections, parmi lesquelles des streptocoques et des Escherichia, des Actinobacter et des Pseudomonas dont on sait le rôle dans diverses dysbioses.
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