Il doit distinguer l’allergie véritable d’une « hypersensibilité alimentaire ». Par exemple :

- L'intolérance au lactose qui provoque météorisme, douleurs abdominales et diarrhées ou l'intolérance au gluten (maladie cœliaque) qui cause également des troubles digestifs. Contrairement aux symptômes allergiques qui surviennent immédiatement après l'ingestion de l'aliment incriminé, ceux d'une intolérance apparaissent progressivement et s'installent dans la durée.